Programa Perú orienta su trabajo a establecer y/o fortalecer las relaciones con instituciones públicas y privadas, especialmente con las organizaciones del movimiento de derechos humanos y derechos de las mujeres, como parte del fortalecimiento, posicionamiento y reconocimiento de PCS/Perú como un actor activo de la cooperación internacional.
En igual medida, se fortalecen relaciones y se realiza labor de acompañamiento con las organizaciones de víctimas y afectados/as por el conflicto armado interno, favoreciendo el desarrollo de sus capacidades para el fortalecimiento de su actoria social y política y su reafirmación de voluntad y compromiso con el proceso de verdad, justicia y reparación en el país.